L’après-midi a été introduite par Roger Genet, Directeur
du CEA Fontenay-aux- Roses. Ce dernier a présenté les trois axes de
recherche du CEA que sont les sciences du vivant, la recherche
technologique et le nucléaire. Il a insisté sur le fait que cette
dernière activité était en décroissance, jusqu’à une extinction
définitive en 2015, au profit de la recherche en sciences du vivant.
Maurice Klein a ensuite présenté l’action BioTIC d’Opticsvalley,
l’inscrivant dans la continuité du colloque Paris-Biophotonique dont se
sont sont tenues trois éditions entre 2003 et 2005. Comme pour la
biophotonique, l’action BioTIC d’Opticsvalley vise à
identifier des croisements entre technologies logicielles et domaines
applicatifs des sciences du vivant, jugés porteurs de développement
économique, puis à rassembler les acteurs concernés pour favoriser des
échanges et faire émerger des projets de coopération.
Jean-Frédéric Gerbeau
de l’INRIA a eu pour propos la simulation numérique du système
cardiovasculaire. Du fondamental à l’appliqué, ces recherches reposent
sur le couplage de modèles, la liaison entre simulation et mesures par
capteurs, avec une approche individualisée en fonction de l’anatomie de
chaque sujet. Elles abordent trois aspects :
- l’utilité
des approches numériques pour adapter des dispositifs médicaux (stents
pour anévrismes) en simulant l’écoulement sanguin dans la carotide
- la
modélisation du fonctionnement du cœur humain en couplant plusieurs
phénomènes physiques et biologiques (mécanique musculaire, écoulement,
électrophysiologie) avec une application à la resynchronisation
cardiaque
- l’étude
d’artefacts en IRM par synthèse d’électrocardiogrammes perturbés par
l’application d’un champ magnétique (effet magnétohydrodynamique).
Jean-François Mangin
de NeuroSpin a parlé de l’analyse automatique des formes du cerveau
pour le diagnostic (voir photo). Dans sa présentation, il a illustré le
renouveau de la morphométrie cérébrale, c’est-à-dire de l’étude des
formes du cerveau en lien avec certaines pathologies. Ce renouveau est
rendu possible par la palette de modalités d’imagerie médicale
permettant d’acquérir des informations fines sur les structures
cérébrales, au premier rang desquelles on retrouve l’IRM.
Martin Vinot de Noesis,
start-up issue de l’INRIA, a ensuite présenté le développement d’une station
d’imagerie pour l’analyse en routine d’échantillons tissulaires, dont
les applications incluent la recherche en cancérologie, la recherche
pharmaceutique et le diagnostic clinique.
Elsa Angelini,
de Télécom Paris, a évoqué les activités de recherche en traitement
d’images médicales menées au sein du département TSI (Traitement du
Signal et de l’Image) du GET, et plus particulièrement du groupe
Traitement et Interprétation des Images. Les approches développées par
ce groupe s’appuient plus particulièrement sur la modélisation des
relations spatiales entre objets, permettant ainsi d’intégrer des
connaissances a priori en anatomie.
Vannary Meas-Yedid,
de l’Institut Pasteur a traité des applications du traitement d'images
en imagerie biologique. Il s’est agi pour elle d’illustrer quelles
étaient les applications de techniques de traitement d’images pour les
problématiques biologiques :
- analyse d’images animées, suivi d’objets (mobilité de parasites, de cellules, de bactéries, de virus)
- détection de contours (telomères, micro-arrays)
- analyse de formes (localisation de protéines)
- restauration / débruitage (localisation 3D de gènes, d’ARN)
Vannary Meas-Yedid
a insisté sur le fait que de nouvelles méthodes étaient proposées pour
répondre aux défis particuliers de l’imagerie biologique (variabilité
importante, besoin de sensibilité et de spécificité, résultats robustes
et répétables).
Françoise Soussaline, P-DG de la start-up IMSTAR, a présenté PathfinderTM, plate-forme pour l’analyse cellulaire à haut contenu et à haut débit, qu'elle développe et commercialise.
Cet exposé a mis en valeur les capacités de la plateforme PathfinderTM pour la cytométrie, avec des applications en recherche biomédicale et pharmaceutique.
Pierre Chagvardieff
du CEA a abordé la thématique "Imagerie biomédicale" du pôle de
compétitivité Medicen Paris Région, bâtie autour de trois points
stratégiques :
1) Les nouveaux enjeux de l’imagerie et des technologies associées : réaliser
des ruptures technologiques fondamentales faisant ainsi progresser la
connaissance du fonctionnement des organes humains et des pathologies
2) Les nouvelles techniques d’imagerie biomédicale pré-clinique : dynamiser
la recherche translationnelle et contribuer ainsi à la compétitivité
des entreprises (bio)pharmaceutiques en réduisant les coûts et les
délais
3) Les nouvelles technologies d’imagerie biomédicale pour le diagnostic et les applications cliniques :
favoriser la diffusion des dispositifs innovants sur le marché et
participer ainsi à la création d’emplois, dans le tissu des PME
notamment.
Marie-Joëlle Antoine, responsable sur service Recherche -Industrie d’Opticsvalley, a conclu ce Rendez-vous en dressant un panorama de l’action BioTIC 2007. Cette action, initiée par Opticsvalley
en 2006, est menée de concert avec un comité de pilotage comprenant le
CEA, l’INRIA, le Genopole ® et l’Assistance Publique des Hôpitaux de
Paris. Elle s’inscrit particulièrement bien dans le contexte médical où
le concours des ingénieurs, informaticiens, médecins et biologistes est
nécessaire pour parvenir à des avancées scientifiques et technologiques. Dans ce domaine pluridisciplinaire, Opticsvalley a pour ambition de rassembler ces différents acteurs pour faire émerger des projets de coopération qui seront ensuite présentés aux financeurs ad hoc.
Ce Rendez-vous s'est ensuite terminé autour d'un cocktail qui a permis aux participants d'échanger. Plus
de 85% d'entre eux ont été stafistaits tant de la pertinence du
programme proposé, que de la qualité des interventions et les
opportunités de nouveaux contacts que ce Rendez-vous a fait émerger.
Le détail des présentations, ainsi que la liste des participants et les photos sont disponibles dans l'Espace Adhérents d'Opticsvalley.
Pour en savoir plus : contacter Marie-Joëlle Antoine
Tél : 01 69 31 60 80 - mj.antoine@opticsvalley.org
Site d'Opticsvalley : pages BioTIC
© Lumière, Opticsvalley, août - septembre 2007
Les quelques 110 participants réunis cet après-midi du 18 septembre dans les locaux du CEA Fontenay-aux-Roses ont pu avoir un aperçu de l’application des TIC aux sciences du vivant à travers les témoignages de laboratoires de recherche tels que le CEA, l’INRIA, le GET et l’Institut Pasteur, ainsi que des PME comme Noesis et Imstar.
Ecouter l'interview de Denis Le Bihan