À la fois chercheur et ingénieur, Jean Jerphagnon développa ses grands talents au plus haut niveau national et international, à la convergence des mondes académique et industriel, avec de fortes préoccupations innovantes au service  de la société et du développement économique territorial. Son action et son influence furent prépondérantes dans de nombreuses réalisations.

En témoignage de reconnaissance, les structures suivantes se sont associées pour créer le ‘‘Prix Jean Jerphagnon’’ : Académie des Technologies, Association Opticsvalley, Centre National de la Recherche Scientifique, Pôle de compétitivité Systematic Paris-Région, Pôle de compétitivité Images et Réseaux, Société des Electriciens et des Electroniciens, Société Française d’Optique, Société Française de Physique, Alcatel-Lucent, France Télécom, Thales.

Fidèle à l’esprit de Jean Jerphagnon, le prix sera attribué à un chercheur ou ingénieur qui propose un projet innovant :

• à grande valeur scientifique ou à fort potentiel industriel
• comportant au moins un élément d’optique ou de photonique
• et marquant une étape dans sa carrière

Le lauréat, âgé au plus de 40 ans, sera sélectionné annuellement à partir des critères suivants :

-  la valeur de ses résultats de recherche

-  sa reconnaissance nationale et internationale

-  sa motivation, la pertinence et les perspectives innovantes de son projet(qu’il soit scientifique ou industriel)

-  les qualités sociétales et/ou économiques présumées pour les applications envisagées

-  les bénéfices potentiels des apports du projet pour la France et l’Europe

Le prix Jean Jerphagnon sera décerné lors d'une journée événement qui se tiendra le 9 décembre 2008 au Collège de France

Le lauréat du prix Jean Jerphagnon se verra remettre la somme de 10 000 euros. En outre, le  comité d'organisation s'engage à l'accompagner pour une durée de deux ans dans la mise en oeuvre de son projet.